Sebagai acuan dalam pelaksanaan dan operasional suatu unit kerja perlu disusun Tugas dan Fungsi Unit Pelaksana Teknis Ditjen KP3K. Tugas dan fungsi UPT ini sebagai langkah dan upaya dalam mengatasi masalah kerusakan dan degradasi sumberdaya alam mengingat potensi yang ada di wilayah pesisir, laut, dan pulua-pulau kecil sangat besar dan perlu dijaga keberlanjutannya.